Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHDQ96IW2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHDQ96IW2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms