Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmo1Q924W9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmo1Q924W9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmo1Q924W9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmo1Q924W9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmo1Q924W9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmo1Q924W9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Lmo1Q924W9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Lmo1Q924W9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Lmo1Q924W9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lmo1Q924W9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
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Lmo1Q924W9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmo1Q924W9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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