Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Snx8Q8CFD4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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