Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp37Q8C0R0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp37Q8C0R0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp37Q8C0R0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms