Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PACS2Q86VP3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms