Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ScocQ78YZ6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms