Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM136Q6ZRR5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms