Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CXCL17Q6UXB2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CXCL17Q6UXB2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CXCL17Q6UXB2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CXCL17Q6UXB2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CXCL17Q6UXB2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms