Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BC061212Q6P8K3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BC061212Q6P8K3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BC061212Q6P8K3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BC061212Q6P8K3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BC061212Q6P8K3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BC061212Q6P8K3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BC061212Q6P8K3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BC061212Q6P8K3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BC061212Q6P8K3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BC061212Q6P8K3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BC061212Q6P8K3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BC061212Q6P8K3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BC061212Q6P8K3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BC061212Q6P8K3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BC061212Q6P8K3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BC061212Q6P8K3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BC061212Q6P8K3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BC061212Q6P8K3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BC061212Q6P8K3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BC061212Q6P8K3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BC061212Q6P8K3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BC061212Q6P8K3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BC061212Q6P8K3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BC061212Q6P8K3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BC061212Q6P8K3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BC061212Q6P8K3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 273.8 ms