Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Foxg1Q60987 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxg1Q60987 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms