Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC178Q5BJE1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC178Q5BJE1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC178Q5BJE1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC178Q5BJE1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC178Q5BJE1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC178Q5BJE1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC178Q5BJE1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC178Q5BJE1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC178Q5BJE1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC178Q5BJE1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC178Q5BJE1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC178Q5BJE1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC178Q5BJE1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC178Q5BJE1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC178Q5BJE1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC178Q5BJE1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC178Q5BJE1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC178Q5BJE1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC178Q5BJE1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC178Q5BJE1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC178Q5BJE1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC178Q5BJE1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC178Q5BJE1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC178Q5BJE1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC178Q5BJE1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC178Q5BJE1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC178Q5BJE1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC178Q5BJE1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC178Q5BJE1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC178Q5BJE1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC178Q5BJE1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms