Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2f8Q58FA4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2f8Q58FA4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2f8Q58FA4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2f8Q58FA4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2f8Q58FA4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2f8Q58FA4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2f8Q58FA4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2f8Q58FA4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2f8Q58FA4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2f8Q58FA4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2f8Q58FA4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
E2f8Q58FA4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2f8Q58FA4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2f8Q58FA4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2f8Q58FA4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2f8Q58FA4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2f8Q58FA4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms