Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Dnah12Q3V0Q1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
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Dnah12Q3V0Q1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnah12Q3V0Q1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Dnah12Q3V0Q1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnah12Q3V0Q1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnah12Q3V0Q1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnah12Q3V0Q1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnah12Q3V0Q1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnah12Q3V0Q1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnah12Q3V0Q1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnah12Q3V0Q1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnah12Q3V0Q1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.9 ms