Protein–RNA interactions for Protein: Q13613

MTMR1, Myotubularin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1Q13613 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTMR1Q13613 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTMR1Q13613 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
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