Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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FOXO1Q12778 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXO1Q12778 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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