Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 APJ1YNL077W 1587 nt5.82□□□□□ -1.48
LSP1Q12230 YJL068CYJL068C 900 nt5.82□□□□□ -1.48
LSP1Q12230 YML057C-AYML057C-A 390 nt5.82□□□□□ -1.48
LSP1Q12230 RSC2YLR357W 2670 nt5.81□□□□□ -1.48
LSP1Q12230 SRP101YDR292C 1866 nt5.81□□□□□ -1.48
LSP1Q12230 NOB1YOR056C 1380 nt5.81□□□□□ -1.48
LSP1Q12230 AXL2YIL140W 2472 nt5.81□□□□□ -1.48
LSP1Q12230 YAP1YML007W 1953 nt5.81□□□□□ -1.48
LSP1Q12230 ZPS1YOL154W 750 nt5.81□□□□□ -1.48
LSP1Q12230 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt5.81□□□□□ -1.48
LSP1Q12230 FOB1YDR110W 1701 nt5.8□□□□□ -1.48
LSP1Q12230 SEC17YBL050W 879 nt5.8□□□□□ -1.48
LSP1Q12230 MRP21YBL090W 534 nt5.8□□□□□ -1.48
LSP1Q12230 REG2YBR050C 1017 nt5.8□□□□□ -1.48
LSP1Q12230 HXT5YHR096C 1779 nt5.8□□□□□ -1.48
LSP1Q12230 SKG3YLR187W 3081 nt5.8□□□□□ -1.48
LSP1Q12230 PRO2YOR323C 1371 nt5.8□□□□□ -1.48
LSP1Q12230 RBA50YDR527W 1320 nt5.79□□□□□ -1.48
LSP1Q12230 RPR2YIR015W 435 nt5.79□□□□□ -1.48
LSP1Q12230 MIM2YLR099W-A 264 nt5.79□□□□□ -1.48
LSP1Q12230 ENP1YBR247C 1452 nt5.77□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 YOR1YGR281W 4434 nt5.77□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 YDR401WYDR401W 564 nt5.77□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 PRO3YER023W 861 nt5.77□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 REV7YIL139C 738 nt5.77□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 SEN34YAR008W 828 nt5.77□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 MNT2YGL257C 1677 nt5.77□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 UTP9YHR196W 1728 nt5.77□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 TDA7YNL176C 1911 nt5.76□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 TIM54YJL054W 1437 nt5.76□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 CTS2YDR371W 1536 nt5.76□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 RPT6YGL048C 1218 nt5.76□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 SEC39YLR440C 2130 nt5.76□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 TRS33YOR115C 807 nt5.76□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 TFB4YPR056W 1017 nt5.76□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 ATG23YLR431C 1362 nt5.76□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 ADY2YCR010C 852 nt5.75□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 SLO1YER180C-A 258 nt5.75□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt5.75□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 EFM4YIL064W 774 nt5.75□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 YKL151CYKL151C 1014 nt5.75□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 MRPL13YKR006C 795 nt5.75□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 POM33YLL023C 840 nt5.75□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 MAP2YBL091C 1266 nt5.75□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 ARG1YOL058W 1263 nt5.74□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 RIM15YFL033C 5313 nt5.74□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 TUP1YCR084C 2142 nt5.74□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 ASA1YPR085C 1332 nt5.74□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 KRE6YPR159W 2163 nt5.73□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 MMT2YPL224C 1455 nt5.73□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 TPS3YMR261C 3165 nt5.73□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 EGD2YHR193C 525 nt5.73□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt5.73□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 YAR061WYAR061W 204 nt5.73□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 SFT2YBL102W 648 nt5.73□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 PDB1YBR221C 1101 nt5.73□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 THI21YPL258C 1656 nt5.72□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 IMD3YLR432W 1572 nt5.72□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 YPL245WYPL245W 1365 nt5.72□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 PGM2YMR105C 1710 nt5.72□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 LHP1YDL051W 828 nt5.72□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 RMR1YGL250W 726 nt5.72□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 YKL023WYKL023W 834 nt5.72□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 YLR194CYLR194C 765 nt5.72□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 MDG1YNL173C 1101 nt5.72□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 SLD7YOR060C 774 nt5.72□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 TFC7YOR110W 1308 nt5.72□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 CLF1YLR117C 2064 nt5.71□□□□□ -1.49
LSP1Q12230 PSE1YMR308C 3270 nt5.71□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 PEX19YDL065C 1029 nt5.71□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 TEF4YKL081W 1239 nt5.71□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 AVO2YMR068W 1281 nt5.71□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 YOR318CYOR318C 306 nt5.71□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 HOS1YPR068C 1413 nt5.71□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 UGA2YBR006W 1494 nt5.71□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 YGL036WYGL036W 2730 nt5.7□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 JEM1YJL073W 1938 nt5.7□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 ECT1YGR007W 972 nt5.7□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 NSG1YHR133C 876 nt5.7□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 YLR118CYLR118C 684 nt5.7□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 NHP6AYPR052C 282 nt5.7□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 WTM2YOR229W 1404 nt5.7□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 YJR124CYJR124C 1347 nt5.7□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 YHR182WYHR182W 2358 nt5.7□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 YER084WYER084W 387 nt5.69□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 YFR035CYFR035C 345 nt5.69□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 CTR2YHR175W 570 nt5.69□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 EGT2YNL327W 3126 nt5.69□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 DEF1YKL054C 2217 nt5.68□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 YDL023CYDL023C 321 nt5.68□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 COG5YNL051W 1212 nt5.68□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 MAK3YPR051W 531 nt5.68□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 DRS1YLL008W 2259 nt5.68□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 MPS3YJL019W 2049 nt5.67□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 ADE13YLR359W 1449 nt5.67□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 NOC4YPR144C 1659 nt5.67□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 YMR102CYMR102C 2505 nt5.67□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 NPY1YGL067W 1155 nt5.67□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 YGR153WYGR153W 654 nt5.67□□□□□ -1.5
LSP1Q12230 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt5.67□□□□□ -1.5
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