Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGL1

LAMTOR4, Ragulator complex protein LAMTOR4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR4Q0VGL1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMTOR4Q0VGL1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMTOR4Q0VGL1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMTOR4Q0VGL1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms