Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata4Q08369 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms