Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NrepQ07475 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NrepQ07475 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NrepQ07475 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NrepQ07475 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NrepQ07475 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NrepQ07475 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NrepQ07475 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NrepQ07475 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NrepQ07475 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NrepQ07475 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms