Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SP4Q02446 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SP4Q02446 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SP4Q02446 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SP4Q02446 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SP4Q02446 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SP4Q02446 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SP4Q02446 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SP4Q02446 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SP4Q02446 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SP4Q02446 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SP4Q02446 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SP4Q02446 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SP4Q02446 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SP4Q02446 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SP4Q02446 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SP4Q02446 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SP4Q02446 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SP4Q02446 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SP4Q02446 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SP4Q02446 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SP4Q02446 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SP4Q02446 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SP4Q02446 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SP4Q02446 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SP4Q02446 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SP4Q02446 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SP4Q02446 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SP4Q02446 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SP4Q02446 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SP4Q02446 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SP4Q02446 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SP4Q02446 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SP4Q02446 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SP4Q02446 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SP4Q02446 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SP4Q02446 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SP4Q02446 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SP4Q02446 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SP4Q02446 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SP4Q02446 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SP4Q02446 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SP4Q02446 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SP4Q02446 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SP4Q02446 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SP4Q02446 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SP4Q02446 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SP4Q02446 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SP4Q02446 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SP4Q02446 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SP4Q02446 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SP4Q02446 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SP4Q02446 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SP4Q02446 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SP4Q02446 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SP4Q02446 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SP4Q02446 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SP4Q02446 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SP4Q02446 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SP4Q02446 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SP4Q02446 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SP4Q02446 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SP4Q02446 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SP4Q02446 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SP4Q02446 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SP4Q02446 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SP4Q02446 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SP4Q02446 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SP4Q02446 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SP4Q02446 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SP4Q02446 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SP4Q02446 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SP4Q02446 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SP4Q02446 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SP4Q02446 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SP4Q02446 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SP4Q02446 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SP4Q02446 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SP4Q02446 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SP4Q02446 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SP4Q02446 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SP4Q02446 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SP4Q02446 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SP4Q02446 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SP4Q02446 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SP4Q02446 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SP4Q02446 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SP4Q02446 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SP4Q02446 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SP4Q02446 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SP4Q02446 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SP4Q02446 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SP4Q02446 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SP4Q02446 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SP4Q02446 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SP4Q02446 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SP4Q02446 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SP4Q02446 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SP4Q02446 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SP4Q02446 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms