Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SCN7AQ01118 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCN7AQ01118 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms