Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HmmrQ00547 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HmmrQ00547 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HmmrQ00547 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms