Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax8Q00288 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pax8Q00288 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms