Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cited1P97769 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cited1P97769 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cited1P97769 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cited1P97769 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cited1P97769 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited1P97769 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cited1P97769 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cited1P97769 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cited1P97769 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms