Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx2P81066 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx2P81066 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx2P81066 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx2P81066 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx2P81066 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx2P81066 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx2P81066 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx2P81066 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx2P81066 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx2P81066 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx2P81066 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx2P81066 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx2P81066 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx2P81066 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx2P81066 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx2P81066 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx2P81066 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx2P81066 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx2P81066 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx2P81066 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx2P81066 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx2P81066 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx2P81066 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx2P81066 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx2P81066 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx2P81066 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx2P81066 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx2P81066 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx2P81066 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx2P81066 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx2P81066 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx2P81066 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx2P81066 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx2P81066 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx2P81066 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx2P81066 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx2P81066 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx2P81066 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx2P81066 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx2P81066 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx2P81066 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx2P81066 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Irx2P81066 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Irx2P81066 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx2P81066 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx2P81066 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx2P81066 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx2P81066 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx2P81066 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Irx2P81066 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx2P81066 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx2P81066 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms