Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Copz1P61924 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Copz1P61924 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Copz1P61924 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Copz1P61924 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Copz1P61924 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Copz1P61924 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Copz1P61924 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Copz1P61924 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Copz1P61924 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Copz1P61924 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Copz1P61924 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Copz1P61924 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Copz1P61924 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Copz1P61924 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Copz1P61924 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Copz1P61924 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copz1P61924 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copz1P61924 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms