Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2kP61087 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2kP61087 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms