Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hps5P59438 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hps5P59438 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hps5P59438 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hps5P59438 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hps5P59438 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hps5P59438 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hps5P59438 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hps5P59438 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hps5P59438 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hps5P59438 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hps5P59438 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hps5P59438 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hps5P59438 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms