Protein–RNA interactions for Protein: P28331

NDUFS1, NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1P28331 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFS1P28331 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFS1P28331 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFS1P28331 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NDUFS1P28331 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFS1P28331 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms