Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa3P28310 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa3P28310 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa3P28310 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa3P28310 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa3P28310 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa3P28310 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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