Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb3P28231 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms