Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P10404 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P10404 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P10404 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P10404 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P10404 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P10404 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
P10404 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
P10404 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P10404 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P10404 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
P10404 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P10404 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P10404 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P10404 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
P10404 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
P10404 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P10404 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P10404 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P10404 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P10404 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P10404 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P10404 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P10404 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P10404 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P10404 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P10404 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
P10404 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P10404 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P10404 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P10404 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P10404 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P10404 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P10404 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P10404 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
P10404 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
P10404 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
P10404 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
P10404 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
P10404 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P10404 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
P10404 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P10404 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P10404 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P10404 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P10404 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
P10404 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P10404 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P10404 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P10404 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
P10404 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
P10404 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
P10404 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
P10404 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
P10404 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P10404 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
P10404 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P10404 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P10404 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P10404 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P10404 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P10404 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
P10404 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
P10404 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
P10404 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P10404 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P10404 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
P10404 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P10404 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P10404 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P10404 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P10404 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P10404 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P10404 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P10404 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P10404 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
P10404 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P10404 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
P10404 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P10404 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
P10404 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
P10404 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
P10404 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P10404 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P10404 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
P10404 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
P10404 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
P10404 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
P10404 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
P10404 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P10404 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P10404 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P10404 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P10404 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
P10404 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
P10404 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
P10404 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P10404 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P10404 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P10404 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms