Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6c1P0CW02 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms