Protein–RNA interactions for Protein: P01820

Ig heavy chain V region PJ14, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01820 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01820 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01820 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01820 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01820 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01820 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01820 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01820 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01820 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01820 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01820 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01820 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01820 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01820 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01820 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01820 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01820 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01820 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01820 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01820 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01820 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01820 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01820 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01820 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01820 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01820 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01820 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01820 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01820 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01820 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01820 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01820 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01820 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01820 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01820 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01820 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01820 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01820 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01820 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01820 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01820 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01820 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01820 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01820 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01820 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01820 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01820 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01820 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01820 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01820 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01820 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01820 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01820 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01820 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01820 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01820 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01820 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01820 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01820 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01820 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01820 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01820 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01820 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01820 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01820 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01820 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01820 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01820 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01820 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01820 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01820 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01820 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01820 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01820 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01820 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01820 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01820 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01820 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01820 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01820 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01820 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01820 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01820 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01820 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01820 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01820 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01820 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01820 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01820 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01820 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01820 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01820 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01820 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01820 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01820 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01820 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01820 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01820 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01820 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01820 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms