Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX58O95786 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX58O95786 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDX58O95786 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDX58O95786 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDX58O95786 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDX58O95786 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDX58O95786 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDX58O95786 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDX58O95786 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDX58O95786 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
DDX58O95786 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDX58O95786 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDX58O95786 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDX58O95786 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDX58O95786 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDX58O95786 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDX58O95786 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDX58O95786 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDX58O95786 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
DDX58O95786 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDX58O95786 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDX58O95786 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDX58O95786 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDX58O95786 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDX58O95786 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
DDX58O95786 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDX58O95786 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDX58O95786 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDX58O95786 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDX58O95786 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDX58O95786 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDX58O95786 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX58O95786 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX58O95786 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX58O95786 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX58O95786 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX58O95786 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX58O95786 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX58O95786 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX58O95786 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDX58O95786 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDX58O95786 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDX58O95786 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDX58O95786 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDX58O95786 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDX58O95786 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDX58O95786 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX58O95786 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX58O95786 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX58O95786 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX58O95786 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX58O95786 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX58O95786 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX58O95786 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX58O95786 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX58O95786 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX58O95786 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX58O95786 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX58O95786 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX58O95786 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
DDX58O95786 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
DDX58O95786 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
DDX58O95786 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX58O95786 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX58O95786 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX58O95786 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX58O95786 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX58O95786 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX58O95786 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX58O95786 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX58O95786 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX58O95786 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX58O95786 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX58O95786 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX58O95786 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX58O95786 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX58O95786 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX58O95786 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX58O95786 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX58O95786 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX58O95786 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX58O95786 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX58O95786 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX58O95786 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX58O95786 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX58O95786 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX58O95786 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX58O95786 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX58O95786 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX58O95786 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX58O95786 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX58O95786 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX58O95786 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX58O95786 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX58O95786 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX58O95786 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX58O95786 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX58O95786 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX58O95786 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms