Protein–RNA interactions for Protein: O88990

Actn3, Alpha-actinin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn3O88990 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actn3O88990 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Actn3O88990 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Actn3O88990 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Actn3O88990 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Actn3O88990 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Actn3O88990 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actn3O88990 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms