Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nfil3O08750 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nfil3O08750 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nfil3O08750 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nfil3O08750 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Nfil3O08750 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nfil3O08750 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nfil3O08750 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nfil3O08750 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nfil3O08750 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nfil3O08750 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nfil3O08750 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nfil3O08750 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nfil3O08750 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nfil3O08750 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nfil3O08750 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nfil3O08750 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nfil3O08750 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nfil3O08750 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nfil3O08750 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nfil3O08750 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nfil3O08750 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nfil3O08750 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nfil3O08750 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nfil3O08750 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nfil3O08750 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nfil3O08750 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nfil3O08750 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nfil3O08750 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms