Protein–RNA interactions for Protein: G5E897

Kdelc2, KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) containing 2, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelc2G5E897 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdelc2G5E897 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdelc2G5E897 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdelc2G5E897 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdelc2G5E897 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdelc2G5E897 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdelc2G5E897 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdelc2G5E897 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdelc2G5E897 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdelc2G5E897 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdelc2G5E897 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdelc2G5E897 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdelc2G5E897 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdelc2G5E897 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdelc2G5E897 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdelc2G5E897 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdelc2G5E897 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdelc2G5E897 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdelc2G5E897 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdelc2G5E897 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdelc2G5E897 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdelc2G5E897 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdelc2G5E897 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdelc2G5E897 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdelc2G5E897 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdelc2G5E897 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdelc2G5E897 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdelc2G5E897 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdelc2G5E897 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdelc2G5E897 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdelc2G5E897 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdelc2G5E897 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdelc2G5E897 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdelc2G5E897 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdelc2G5E897 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdelc2G5E897 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdelc2G5E897 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdelc2G5E897 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdelc2G5E897 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdelc2G5E897 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdelc2G5E897 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdelc2G5E897 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdelc2G5E897 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdelc2G5E897 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdelc2G5E897 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdelc2G5E897 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdelc2G5E897 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdelc2G5E897 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdelc2G5E897 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdelc2G5E897 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdelc2G5E897 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdelc2G5E897 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdelc2G5E897 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdelc2G5E897 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdelc2G5E897 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdelc2G5E897 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms