Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
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Zfp558E9Q1J0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zfp558E9Q1J0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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