Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc8D3YZV8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc8D3YZV8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms