Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HNRNPCL3B7ZW38 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HNRNPCL3B7ZW38 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms