Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEIS3P2A8K0S8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MEIS3P2A8K0S8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms