Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ctu1Q99J10 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ctu1Q99J10 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ctu1Q99J10 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ctu1Q99J10 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ctu1Q99J10 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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