Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
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