Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cln3Q61124 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Cln3Q61124 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cln3Q61124 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Cln3Q61124 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Cln3Q61124 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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Cln3Q61124 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Cln3Q61124 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Cln3Q61124 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms