Protein–RNA interactions for Protein: Q5JST6

EFHC2, EF-hand domain-containing family member C2, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC2Q5JST6 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms