Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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