Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RELBQ01201 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RELBQ01201 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms