Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC130P13994 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms