Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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PFDN4Q9NQP4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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